Postopek zamrzovalnega sušilnika je v glavnem razdeljen na dve stopnji, ena je faza zamrzovanja, druga pa faza vakuuma (imenovana tudi faza sušenja ali sublimacije). Mnogi ljudje mislijo, da nižja kot je temperatura zmrzovanja in vakuum v fazi sušenja, bolje je pri uporabi zamrzovalnega sušilnika, vendar temu ni tako.
Lastnosti vsakega materiala so različne, zato so njihove kristalizacijske točke različne. Temperatura zmrzovanja in temperatura zajetja vode v fazi zamrzovanja zamrzovalnega sušilnika se v glavnem določita glede na značilnosti samega materiala, ne nižja, tem bolje, in temperatura je prenizka. Zapravljajte energijo in drugič podaljšajte čas materiala v zamrzovalnem sušilniku.
Fazo sušenja lahko nadalje razdelimo na predsušenje, primarno sušenje in sekundarno sušenje. Uporaba vsake stopnje in dosežena stopnja sušenja sta odvisna predvsem od procesa sušenja.
Predsušenje zamrzovalnega sušilnika se nanaša na prvo stopnjo sušenja, ki v glavnem odstrani prosto vlago; primarno sušenje zamrzovalnega sušilnika se nanaša na stopnjo sušenja, ki v glavnem odstrani prosto vlago, prvo sušenje pa se lahko izvede le v vakuumu; drugo sušenje zamrzovalnega sušilnika Nanaša se na stopnjo sušenja od sušenja z zamrzovanjem do popolne odstranitve vlage v trdnem polimernem stanju.
